De momento, ese nudo parece bien gestionado. No quites madera a su alrededor, ni por encima. Si tuvieras que quitar madera, hazlo del vientre, como dices.
De todas formas, un nudo de esas dimensiones en una pala (yo no veo que esté en el medio, pero igual es la perspectiva de la foto) no augura nada bueno.
Y esas líneas negras de hongos, tampoco.
A juzgar por lo que veo en las fotos, yo diría que esa madera está podrida, pero no lo sé a ciencia cierta.