Hombre, una cosa son pinturas o grabados parietales, que, en efecto, pueden pasar desapercibidos si no se explora sistemáticamente y con diferentes iluminaciones desde distintos ángulos, y otra son restos óseos, que suelen estar en el suelo.
Y si se excava hasta llegar a la roca madre... es difícil que se le pasen a uno huesos que se vaya encontrando en algún estrato...
A menos que la excavación sea exhaustiva, y se vacíe y cribe TODO el fondo de la cueva.
Generalmente se hacen catas, y solamente algunos yacimientos se excavan completa y totalmente.
Y más ahora, que hay recortes por todas partes.
No conozco los casos que mencionas en Álava, así que no puedo hablar.